Prosjektnummer
SalmoChange – Genetikk villaks og oppdrettslaks: Påvirkningsfaktorer
Atlantiske laksepopulasjoner påvirkes av ulike menneskelige (antropogene) aktiviteter på lokal og regional skala. I et nylig oppdatert register for Norge som vedlikeholdes av Direktoratet for naturforvaltning (2012), blir laksepopulasjonene i 54 elver kategorisert som kritisk truet eller utryddet i naturen. Vannregulering og forsuring er listet som den viktigste faktor for utryddelse i henholdsvis 23 og 14 av disse elvene. Med bakgrunn i effektene på populasjonenes levedyktighet og produktivitet, er det interessant å vite om det er mulig å finne effekter av vannregulering og forsuring på genetisk nivå; enten ved tap av genetisk variasjon eller ved adaptive responser (tilpasninger) til endrete seleksjonsregimer. Hensikten med denne studien var derfor å studere genetisk variasjon i populasjoner av atlantisk laks i Vest-Norge som har erfart miljøendringer grunnet vannregulering og forsuring.
Genomisk variasjon ble undersøkt i 3761 Single Nucleotide Polymorphism (SNP - uttales “snip” = punktmutasjoner) markører i atlantisk laks fra 25 laksepopulasjoner i vest- og sørvest-Norge. Studien avdekket SNPer som skiller laks som har vært utsatt for forsuring og vannregulering fra laks som ikke har vært påvirket, eller påvirket i mindre grad. Det er mulig at disse SNP-markørene skiller populasjonene på grunn av seleksjon som virker på gener som er tett lenket til dem; men også andre mekanismer kan forårsake slik differensiering. Selv om elvene i denne studien ble valgt basert på sin historie med forsuring og/eller regulering, er det sannsynlig at de også har vært utsatt for andre menneskelige påvirkningsfaktorer. Omfanget av studien ga ikke rom for nøyaktig testing av seleksjon for disse markørene på grunn av mangel på historiske prøver og lite prøvemateriale. Likevel kan ikke seleksjon utelukkes som årsak til den genetiske differensieringen. For å bestemme hvilken betydning funnene har for “fitness” til laksepopulasjoner påvirket av de studerte menneskelige aktivitetene (forsuring og vannregulering) vil det være nødvendig å inkludere flere prøver fra større områder for å estimere effekt på populasjonsstørrelser og endring i genetisk variasjon over tid.
Det er utarbeidet en egen teknisk sluttrapport i tillegg til selve sluttrapporten, siden mye av den faglige terminologien ikke er lett tilgjengelig for dem som ikke er inne på fagfeltet.
-
Final report: Genetic variation in Norwegian Atlantic salmon (Salmo salar L.) associated with anthropogenic activity. Final report
Nofima. Report 11/2013. February 2013. By Céleste Jacq, Jan Brekke, Matthew Kent, Sigbjørn Lien, Kjetil Hindar and Sten Karlsson.
-
Report: Genetic variation in Norwegian Atlantic salmon (Salmo salar L.) associated with anthropogenic activity (Technical report)
Nofima. Report 10/2013. February 2013. By Céleste Jacq, Jan Brekke, Matthew Kent, Sigbjørn Lien, Kjetil Hindar and Sten Karlsson.
Med dagens muligheter for detaljerte genetiske analyser og sammenligninger av arvemateriale er det mulig å se hvordan ulike faktorer kan ha påvirket den genetiske karakteristikken for laks. Dette gjelder både for mulig genetisk påvirkning fra rømt oppdrettslaks, til mulig genetisk påvirkning fra andre miljøendringer slik som sur nedbør, vannkraftutbygginger, klimaendringer, grusuttak, laksetrapper osv.
For å se hvordan slike faktorer kan ha påvirket genetiske karakteristikker for ulike laksestammer skal det gjennomføres en kartlegging av hvilke miljøfaktorer som har påvirket laks i en rekke vassdrag i Hordaland og Sogn. Tidligere er det gjort en kartlegging av utsettinger av laks i vassdrag i Nord-Trøndelag.
Med basis i denne kunnskapsoversikten skal det samles inn biologisk materiale (skjellprøver og annet) fra laks før og etter de aktuelle påvirkningene skjedde. Historisk materiale må søkes i museer og andre kilder. Ved genetiske analyser basert på en såkalt DNA-mikromatrise (SNP-chip) med mer enn 5000 genetiske markører fra laks er det et mål å se hvordan ulike påvirkningsfaktorer kan ha påvirket laksestammene genetisk.
• genetiske sammenlignende analyser “før og etter” ulike påvirkningsfaktorer på villaksstammene i Hordaland og Sogn
• genetiske sammenligninger av laks før og etter utsetting av laks fra ikke-stedegen stamme i Nord-Trøndelag
Det skal gjennomføres en feltkartlegging av alle påvirkningsfaktorer med antatt betydning på ville laksestammer i utvalgte elver i Hordaland og Sogn, samtidig som det forsøkes fremskaffet mest mulig biologisk historisk materiale fra laks fra de samme vassdragene.
Det historiske biologiske materialet analyseres sammen med nyere biologisk materiale fra laks fra de samme elvene. Dette arbeidet utføres ved CIGENE-senteret på Ås/UMB.
Om begge disse vil være aktuelle dersom bare fase 1 blir gjennomført må avgjøres basert på hvilke resultater som foreligger.
Videre vil det publiseres resultater på FHF sin nettside. En del-leveranse vil også være: